championnat d'Estonie de football 2003

La saison 2003 du Championnat d'Estonie de football était la 13e édition de la première division estonienne à poule unique, la Meistriliiga. Les huit clubs jouent les uns contre les autres au sein d'une poule unique où chaque adversaire rencontre les autres équipes deux fois à domicile et deux fois à l'extérieur. C'est le FC Flora Tallinn, double champion en titre, qui termine en tête du championnat. C'est le 7e titre de champion d'Estonie de son histoire. C'est la première fois dans l'histoire du championnat qu'une équipe gagne le titre trois saisons consécutives.