Fosmidi
Sign in to saveFosmids are similar to cosmids but are based on the bacterial F-plasmid. The cloning vector is limited, as a host (usually E. coli) can only contain one fosmid molecule. Fosmids can hold DNA inserts of up to 40 kb in size; often the source of the insert is random genomic DNA. A fosmid library is prepared by extracting the genomic DNA from the target organism and cloning it into the fosmid vector. The ligation mix is then packaged into phage particles and the DNA is transfected into the bacterial host. Bacterial clones propagate the fosmid library. The low copy number offers higher stability t
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I fosmidi sono vettori a DNA simili ai cosmidi ma basati sul batterico plasmide F. Il vettore di clonaggio è limitato, in quanto l'ospite (generalmente E. coli) può contenere un'unica molecola fosmidica. I fosmidi possono acquisire un inserto di massimo 40 kb; spesso la fonte dell'inserto è una sequenza di DNA genomico randomica. Una library fosmidica viene preparata estraendo il DNA genomico dall'organismo bersaglio e lo si clona nel vettore fosmidico. La miscela di ligazione viene, dunque, impacchettata in particelle fagiche e mediante infezione il DNA è inserito nelle cellule ospiti. Le colonie batteriche propagheranno la libreria fosmidica. Il basso numero di copie per ciascun ospite conferisce una maggiore stabilità al vettore rispetto anche ai cosmidi. I fosmidi risultano avere particolare utilità per la costruzione di librerie genomiche stabili. Si è osservato che essi sono in grado di mantenere attivo il DNA umano anche dopo 100 generazioni batteriche. Cloni fosmidici sono stati adoperati per migliorare l'accuratezza della sequenza genomica umana ritrovata nel Progetto Genoma Umano.
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