Skip to content
EntityQ2888953· pop 11· linked from 37 articles

Bioconductor

Sign in to save

Software

Key facts

Software.name
Bioconductor
Software.logo
Bioconductor logo.svg
Software.logo size
260px
Software.caption
Screenshot of Bioconductor
Software.latest_release_version
3.22
Software.operating_system
Linux, macOS, Windows
Software.platform
R programming language
Software.genre
Bioinformatics
Software.license
Artistic License 2.0

via Wikipedia infobox

Wikidata facts

Instance of
software
Based on
R
Official website
www.bioconductor.org
Image
Bioconductors packs plot.png
Show 8 more facts
copyright license
Artistic License
software version identifier
3.6
operating system
Microsoft Windows
programmed in
R
social media followers
1128
readable file format
FASTA format
Sources (6)

via Wikidata · CC0

Article · Deutsch

Bioconductor ist eine Sammlung von Paketen (Programmbibliotheken), welche die statistische Programmiersprache R um Erweiterungen aus der Bioinformatik, insbesondere der Analyse von Genexpressionsdaten erweitert. Bioconductor wurde 2001 gegründet und ist ein Open-Source-Projekt. Ziel war es eine Plattform zu schaffen um Softwareentwicklungen transparenter zu gestalten um mehrfache Arbeit zu reduzieren und statistische sowie grafische Methoden und Modelle für Gendaten zu bündeln und zu ihrer Kollaboration zu ermutigen. Bioconductor bietet mittlerweile ein Repository aus dem über 1200 Pakete für R heruntergeladen werden können. Eines der wichtigsten und ältesten Pakete ist Biobase, welches eine Datenstruktur mit sich bringt, welche an die Erfordernisse von Gendaten angepasst ist, sodass sich darin ein Datensatz von Experimenten mit Microarrays (assayData) zusammen mit typischen Metadaten (metadata) und beschreibenden Informationen (experimentData) speichern lässt, weswegen viele weitere Pakete darauf zurückgreifen. Der Versionszyklus und die Versionsnummern folgen R.

Abstract from DBpedia / Wikipedia · CC BY-SA