コンティグ
Sign in to savethumb|Overlapping reads from paired-end sequencing form contigs; contigs and gaps of known length form Scaffolding (bioinformatics)|scaffolds.A contig (from contiguous) is a set of overlapping DNA segments that together represent a consensus region of DNA. In bottom-up sequencing projects, a contig refers to overlapping sequence data (reads); in top-down sequencing projects, contig refers to the overlapping clones that form a physical map of the genome that is used to guide sequencing and assembly. Contigs can thus refer both to overlapping DNA sequences and to overlapping physical segments (f
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コンティグ（Contig）は、DNA配列断片群を重ね合わせ(シーケンスアライメント)して できるコンセンサス配列や、それを構成する配列断片群のことを指す、ゲノミクス分野における用語である 。英単語の'contiguous'に由来している('continuous'ではないことに注意)。 この用語には、大きく分けて２つの意味合いがある。ひとつは、ボトムアップのシークエンシングプロジェクトにおけるものであり、この方法ではによって得られた短い配列断片(read)をアセンブルすることによって、リード末端が連続的に重なり合うように伸長された配列群を情報処理的に得ることができ、この大きな配列断片のことをコンティグと呼ぶ。一方でトップダウンのシークエンシングプロジェクトにおいては、生物が持つ長大なゲノム配列の全体を遺伝子地図のレベルの大きな長さ単位で端が重複するように物理的にせん断するが、この部分的に重複したゲノムクローンの断片のことをコンティグと呼称する。すなわちコンティグとは、リードの重ね合わせと伸長から得られる大きなDNA断片配列と、染色体ゲノムの物理的なせん断から得られる部分的に重複したクローンDNA、の両方を指す用語となっている。
Abstract from DBpedia / Wikipedia · CC BY-SA