Reagrupamiento

El reagrupamiento es la mezcla del material genético de una especie en nuevas combinaciones en distintos individuos. Varios procesos diferentes contribuyen al reagrupamiento, incluidos la diversidad de cromosomas y los intercambios cromosómicos.​ Se emplea, sobre todo, cuando dos virus afines que infectan a la misma célula intercambian material genético. En particular, el reagrupamiento se produce entre los virus de la gripe, cuyos genomas se componen de ocho segmentos distintos de ARN. Estos segmentos actúan como minicromosomas, y cada vez que se ensambla un virus de la gripe, requiere una copia de cada segmento. Si un solo huésped (un ser humano, un pollo u otro animal) se infecta de dos cepas diferentes del virus de la gripe, entonces es posible que se formen nuevas partículas virales ensambladas a partir de segmentos cuyo origen es desigual; algunos provendrán de una cepa, y otros de otra. La nueva cepa reagrupada compartirá propiedades de sus dos linajes parentales. El reagrupamiento es responsable de algunos de los grandes cambios genéticos de la historia del virus de la gripe. Las cepas de la gripe pandémica de 1957 y de 1968 fueron causadas por el reagrupamiento entre un virus aviar y un virus humano, mientras que el virus H1N1, responsable del brote de gripe porcina en 2009, tiene una combinación inusual de secuencias genéticas de gripe porcina, aviar y humana.​ La familia del reptarenavirus, responsable de la enfermedad por cuerpos de inclusión en serpientes, muestra un alto grado de diversidad genética debido a la reagrupación de material genético de numerosas cepas en el mismo animal infectado.