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CRISPR

File:4QYZ.png · Wikimedia Commons · See Wikimedia Commons

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Also known as clustered regularly interspaced short palindromic repeats

sistema que consiste em pequenas porções do DNA bacteriano compostas por repetições de nucleotídeos

Key facts

Nonhuman protein.Name
Cascade (CRISPR-associated complex for antiviral defense)
Nonhuman protein.image
4QYZ.png
Nonhuman protein.caption
CRISPR Cascade protein (cyan) bound to CRISPR RNA (green) and phage DNA (red)
Nonhuman protein.Organism
Escherichia coli
Nonhuman protein.TaxID
511145
Nonhuman protein.Symbol
CRISPR
Nonhuman protein.EntrezGene
947229
Nonhuman protein.PDB
4QYZ
Nonhuman protein.UniProt
P38036
Nonhuman protein.RefSeqProtein
NP_417241.1
Protein family.Symbol
CRISPR_assoc
Protein family.Name
CRISPR associated protein CasC/Cse3/Cas6 (Type I effector RNase)
Protein family.image
PDB 1wj9 EBI.jpg
Protein family.caption
Crystal structure of a crispr-associated protein from Thermus thermophilus
Protein family.Pfam
PF08798
Protein family.InterPro
IPR010179
Protein family.CDD
cd09727
Protein family.Pfam_clan
CL0362

via Wikipedia infobox

Research

67,864 papers

via PubMed

Wikidata facts

Subclass of
DNA sequence
Image
CAS 4qyz.png
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Commons category
CRISPR
derivative work
CRISPR-Cas method
location of discovery
University of Osaka
discoverer or inventor
Yoshizumi Ishino
time of discovery or invention
1987-00-00
Sources (2)

via Wikidata · CC0

Article · Português

O sistema CRISPR (do inglês Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats), ou seja, Repetições Palindrômicas Curtas Agrupadas e Regularmente Interespaçadas, consiste em pequenas porções do DNA bacteriano compostas por repetições de nucleotídeos. Cada uma dessas repetições encontra-se adjacente a um “protoespaçador” (“espaçador de DNA”), que corresponde a uma região não-codificante inserida no DNA bacteriano após o contato com genomas invasores provenientes de bacteriófagos ou plasmídeos. A transcrição do locus CRISPR resulta em pequenos fragmentos de RNA com capacidade de desempenhar o reconhecimento de um DNA exógeno específico e atuar como um guia de modo a orientar a nuclease Cas, que irá promover a clivagem e consequente eliminação do DNA invasor caso este entre novamente em contato com a bactéria, atuando como importante mecanismo de defesa contra DNAs invasores . O CRISPR é frequentemente usado como um termo geral para se referir à edição genômica, mas é o acoplamento do CRISPR e do sistema Cas9 que permite a deleção seletiva do DNA. Diversos são os mecanismos pelos quais a molécula de guia pode ser sintetizada, entretanto, o sistema tipo II no qual baseiam-se os sistemas atualmente disponíveis para realização da edição gênica, requer a presença de um RNA transativador (tracRNA), e uma molécula pequena de RNA complementar à sequência repetida capaz de associar-se ao transcrito inicial do locus CRISPR, denominada CRISPR RNA (crRNA-sequências que consistem em um protoespaçador ligado a uma sequência repetida com estrutura de grampo). Esta associação origina o complexo tracRNA-crRNA, uma molécula de RNA dupla fita que após ser processada pela RNase III é convertida em uma molécula híbrida madura com função importante no que diz respeito à associação e direcionamento de uma nuclease para eliminação do DNA invasor. Nesse sistema especificamente, a nuclease envolvida na clivagem refere-se à Proteína Associada a CRISPR 9 (Cas9) . A alta taxa de insucesso, custo elevado e excesso de tempo necessário para realização das metodologias disponíveis para edição gênica, tais como Recombinação Homóloga (comumente empregada na manipulação genica de células-tronco), Nucleases Dedos de Zinco (ZFN, do inglês Zinc Fingers Nucleases) e Nucleases Efetoras semelhantes à Ativadores de Transcrição (TALENs, do inglês Transcription Activator–like Effector Nucleases), estas duas últimas requerem o reconhecimento em ambas as fitas de DNA para que a clivagem promovida por nucleases sintetizadas especificamente para tais metodologias seja bem sucedida, o que nos permite considerar tais métodos mais trabalhosos quando comparados ao sistema CRISPR . A junção de todos estes fatores fez com que a recente descoberta de um sistema imune bacteriano contra fagos e plasmídeos invasores ganhasse destaque no que diz respeito a técnicas de edição gênica e obtenção de organismos geneticamente modificados (OGMs) . Atualmente encontra-se disponível um gRNA (RNA guia) que consiste na construção de uma molécula de RNA desenvolvida biotecnologicamente, com a capacidade de mimetizar o que ocorre naturalmente em bactérias, e desta forma, promover o direcionamento da nuclease Cas9 para uma sequência alvo específica para que esta promova a clivagem e a sequência de interesse tornando esta disponível para atuação da maquinaria de reparo da célula e assim, promover edição da porção de interesse presente no genoma alvo. Tais fundamentos nos permitem considerar o sistema CRISPR (CRISPR/Cas) uma técnica rápida, com relativa facilidade de manipulação e baixo custo quando comparada a técnicas anteriores . No entanto, este sistema não é restrito a bactérias, o gigantesco Mimivírus se defende de invasores utilizando um semelhante sistema CRISPR implementado por bactérias e outros microorganismos. O sistema de defesa do Mimivírus pode levar a novas ferramentas de edição de genoma.

Abstract from DBpedia / Wikipedia · CC BY-SA

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