Illumina/Solexa method

Метод Illumina/Solexa — метод секвенирования нового поколения, разработанный компанией Solexa. В основе метода лежит принцип секвенирования путём синтеза: * Одноцепочечные фрагменты ДНК закрепляются на твердой подложке. * ДНК-зависимая ДНК полимераза синтезирует комплементарную цепь. * Встраивание каждого нового нуклеотида регистрируется с помощью камеры. В методе Solexa используются 3'- модифицированные нуклеотиды с присоединенными флюоресцентными метками разных цветов. Модификация нуклеотидов не позволяет ДНК-полимеразе присоединить больше одного нуклеотида. Флюоресценция инициируется коротким импульсом лазера и тип присоединенного нуклеотида определяется по цвету флюоресцентной метки. Модификация нуклеотида блокируется (полимераза теперь может двигаться дальше) и цикл повторяется снова. В результате удается определить последовательность ДНК длиной до 250 нуклеотидов. Такую последовательность ДНК называют прочтением или ридом — (калька с английского). Первый секвенатор Genome Analyzer 1G был представлен компанией Solexa в 2006 году. Длина прочтения составляла 30-35 нуклеотида, можно было получить около 1 Gb информации. HiSeq 2000 (2011 год) способен секвенировать 6 человеческих геномов за 11 дней. Длина прочтения составляет 100 нуклеотидов, можно получить 600 Gb информации.