SPEN
Sign in to saveAlso known as HIAA0929, MINT, RBM15C, SHARP, spen family transcriptional repressor, RATARS
Msx2-interacting protein is a protein that in humans is encoded by the SPEN gene.
In the Vinony graph
Within Vinony's link graph, SPEN is referenced by 7 other articles, and connects out to PubMed, human chromosome 1 and Ensembl genome database project.
It is catalogued under the topic Genes on human chromosome 1.
Its subject is documented across 9 Wikipedia language editions.
Gene data
SPEN- Name
- spen family transcriptional repressor
- Type
- protein-coding
- Position
- 15,836,095–15,940,456 (+)
- Aliases
- HIAA0929, MINT, RATARS, RBM15C, SHARP
- Ensembl
- ENSG00000065526
- RefSeq RNA
- NM_015001.3
- RefSeq protein
- NP_055816.2
This gene encodes a hormone inducible transcriptional repressor. Repression of transcription by this gene product can occur through interactions with other repressors, by the recruitment of proteins involved in histone deacetylation, or through sequestration of transcriptional activators. The product of this gene contains a carboxy-terminal domain that permits binding to other corepressor proteins. This domain also permits interaction with members of the NuRD complex, a nucleosome remodeling protein complex that contains deacetylase activity. In addition, this repressor contains several RNA recognition motifs that confer binding to a steroid receptor RNA coactivator; this binding can modulate the activity of both liganded and nonliganded steroid receptors. [provided by RefSeq, Jul 2008].
Gene Ontology
Biological process
Molecular function
Pathways
via MyGene.info
Gene · Ensembl
spen family transcriptional repressor
- Symbol
- SPEN
- Biotype
- Protein coding
- Organism
- Homo sapiens
- Location
- 1:15,836,095-15,940,456
- Strand
- Forward (+)
- Assembly
- GRCh38
via Ensembl · EMBL-EBI
Wikidata facts
- Instance of
- gene
- Image
- Protein SPEN PDB 1ow1.png
Show 8 more facts
- HomoloGene ID
- 124461
- found in taxon
- Homo sapiens
- exact match
- identifiers.org/ncbigene/23013
- genomic end
- 15940456
- genomic start
- 15836095
- chromosome
- human chromosome 1
- cytogenetic location
- 1p36.21-p36.13
- expressed in
- ascending aorta
Sources (4)
via Wikidata · CC0
Article · Русский
Белок, взаимодействующий с Msx2 — белок, кодируемый у человека геном SPEN . Этот ген кодирует гормон, индуцируемый репрессором транскрипции. Репрессия транскрипции продукта этого гена может произойти в результате взаимодействия с другими репрессорами, благодаря рекрутированию белков, участвующих в дезацетилировании гистонов, или путём поглощения транскрипционных активаторов. Продукт этого гена содержит карбоксильно-концевой домен, который позволяет связывание с другими белками корепрессора. Этот домен также позволяет взаимодействие с членами комплекса NuRD, нуклеосомного комплекса белкового ремоделирования, который содержит активные деацетилазы. Кроме того, этот репрессор содержит несколько мотивов распознавания РНК, которые позволяют связывание с стероидным рецептором коактиватора РНК; это связывание может модулировать активность как лигандных, так и нелигандных стероидных рецепторов.
Abstract from DBpedia / Wikipedia · CC BY-SA