Petit ARN en épingle à cheveux

Les petits ARN en épingle à cheveux (en anglais shRNA, de short hairpin signifiant « petite épingle à cheveux ») sont des ARN adoptant une structure en tige et boucle pouvant être utilisé pour réduire l'expression d'un gène cible via phénomène d'interférence par ARN. L'expression des shRNAs dans des cellules est réalisée la plupart du temps par le biais de plasmides ou par des vecteurs viraux ou bactériens. Le choix du promoteur est essentiel pour obtenir une expression robuste du shRNA. Au début de l'utilisation de cette technologie, les promoteurs de la polymérase III comme U6 et H1 étaient couramment choisis mais ces promoteurs ne permettent ni un contrôle spatial ni un contrôle temporel de l'expression de l'ARN. Ainsi, progressivement les promoteurs de la polymérase II ont été de plus en plus utilisés pour réguler l'expression des shRNA. Ces petits ARNs sont un très bon médiateur de l'interférence par ARN car ils ont un faible taux de dégradation et une bonne stabilité. Ils sont par conséquent très avantageux à utiliser pour réaliser l'extinction d'un gène cible. Cependant ils peuvent poser des problèmes de sécurité car ils nécessitent l'utilisation de vecteurs d'expression qui peuvent infecter l'homme.